Las bacterias y algas marinas son una fuente inagotable de compuestos químicos que permiten producir una amplia variedad de metabolitos secundarios bioactivos. Las bacterias marinas se han convertido en objetivo importante para la industria de la biotecnología debido a la alta cantidad de compuestos bioactivos descubierto recientemente a partir de ellas. El objetivo de este estudio fue evaluar la actividad anticancerígena y antibacteriana de extractos de las algas marinas Egregia menziesii, Codium fragile, Sargassum muticum, Endarachne binghamiae, Centroceras clavulatum y Laurencia pacifica recolectadas en Bahía Todos Santos, México. Se obtuvieron extractos orgánicos a partir de las algas libres de bacterias y de las bacterias asociadas a su superficie. Para probar la actividad antibacteriana se emplearon las cepas patógenas Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis y Pseudomonas aeruginosa y para la actividad anticancerígena, células de carcinoma colorectal HCT-116. De la superficie de las algas marinas se aislaron 35 cepas bacterianas que se identificaron molecularmente y pertenecían a los phyla Firmicutes, Proteobacteria, y Actinobacteria. Las cepas Cc51 aislada de Centroceras clavulatum, Sm36 aislada de Sargassum muticum, y Eb46 aislada de Endarachne binghamiae mostraron actividad anticancerígena con un IC50 de 6,492, 5,531 y 2,843 µg ml-1 respectivamente. Asimismo, los extractos de las bacterias asociadas a las algas marinas inhibieron el crecimiento de la bacteria Gram negativa Proteus mirabilis. La actividad biológica observada en este estudio ofrece la oportunidad de un análisis químico posterior, tal como el aislamiento de los compuestos activos responsables, a fin de contribuir en el descubrimiento de nuevos fármacos.