基于网络药理学和分子对接技术分析清肺排毒汤治疗COVID-19的机制

Abstract

基于网络药理学和分子对接技术分析清肺排毒汤治疗COVID-19的作用靶点、信号通路和生物学功能。 利用TCMSP、SwissTarget Prediction、CooLGeN、GeneCards、DAVID等数据库，分析清肺排毒汤中麻黄、半夏等21味药所含的活性成分及其靶点蛋白，筛选与COVID-19疾病共有的靶点蛋白及其信号通路与生物学功能，采用Gephi软件构建清肺排毒汤药味-活性成分-作用靶点-生物学功能网络图。 清肺排毒汤中麻黄、半夏、甘草、冬花、紫菀、枳实等18味药的MOL000519、MOL000554、MOL004798、MOL004824、MOL010428、MOL013443等163个活性成分通过调控ACE、ACE2、AGTR1、FURIN、TNF、CASP3、CASP6、DPP4、MCL1、POLD1等10个蛋白靶点激活肾素-血管紧张素系统信号通路和细胞凋亡信号通路，发挥肾素-血管紧张素对血容量的调节、肾素-血管紧张素对全身动脉血压的调节等42种生物学功能治疗COVID-19。初步分子对接结果显示，核心活性成分MOL000519（来自半夏）、MOL000554（来自冬花）、MOL004798（来自麻黄）、MOL004824（来自甘草）、MOL010428（来自紫菀）、MOL013443（来自枳实）等与SARS-CoV-2 3CL水解酶有较好的亲合力，可形成稳定构象，具有较好结合活性（结合能≤-5 kJ/mol）。 清肺排毒汤以多药味、多靶点、多信号通道和多生物学功能发挥治疗COVID-19作用，该研究可为深入阐释清肺排毒汤治疗COVID-19的药理作用及机制提供参考。