Genetic diversity and functional status of oipA GENE Helicobacter pylori, its association with island of pathogenicity genes in patients with gastroduodenal diseases in the Republic of Belarus
- 1 January 2022
- journal article
- Published by Media Sphere Publishing Group in Molecular Genetics Microbiology and Virology (Russian version)
- Vol. 40 (4)
- https://doi.org/10.17116/molgen2022400419
Abstract
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ Изучить вариабельность структурной организации гена oipA и его функциональный статус в образцах H. pylori с использованием метода секвенирования, оценить его связь с наличием генов острова патогенности cagPAI и характером клинического течения хеликобактериоза. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ Объектом исследования были 84 образца ДНК H. pylori, выделенных из биоптатов антрального отдела слизистой оболочки желудка пациентов с различными гастродуоденальными заболеваниями. Детекция генов острова патогенности HP (cagPAI) была выполнена методом ПЦР. Анализ функционального статуса гена oipA проводили методом секвенирования. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ Установлено, что 79,8% образцов H. pylori имеют статус гена oipA «включен», а остальные 20,2% образцов имели нефункциональный статус гена. Показано, что статус oipA «включен» достоверно ассоциирован с повышенным риском развития язвы ДПК по сравнению с поверхностным гастритом (poipA и риском развития атрофического гастрита не выявлено. Исследование показало высокую частоту выявления генов острова патогенности среди образцов ДНК H. pylori со статусом гена oipA «включен». Наблюдается достоверная корреляция между включенным геном oipA и наличием всех изученных генов cagPAI, наибольший коэффициент корреляции отмечен для генов cagT и cagM. ЗАКЛЮЧЕНИЕ Связь между функциональным статусом гена oipA и факторами патогенности, кодируемыми островом патогенности cagPAI, играет важную роль в патогенезе H. pylori и требует дальнейшего изучения.This publication has 22 references indexed in Scilit:
- Association of presence/absence and on/off patterns of Helicobacter pylori oipA gene with peptic ulcer disease and gastric cancer risks: a meta-analysisBMC Infectious Diseases, 2013
- Helicobacter pylori oipA genetic diversity and its associations with both disease and cagA, vacA s, m, and i alleles among Bulgarian patientsDiagnostic Microbiology and Infectious Disease, 2011
- The cag PAI is intact and functional but HP0521 varies significantly in Helicobacter pylori isolates from Malaysia and SingaporeEuropean Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 2010
- Helicobacter pylori oipA, vacA and dupA genetic diversity in individual hostsJournal of Medical Microbiology, 2010
- Evaluation of the Clinical Significance ofhomB,a Novel Candidate Marker ofHelicobacter pyloriStrains Associated with Peptic Ulcer DiseaseThe Journal of Infectious Diseases, 2008
- Prevalence of virulence-associated genotypes of Helicobacter pylori and correlation with severity of gastric pathology in patients from western Sicily, ItalyEuropean Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 2008
- Helicobacter pylori outer membrane proteins and gastroduodenal diseaseGut, 2006
- Comparing Genomes of Helicobacter pylori Strains from the High-Altitude Desert of Ladakh, IndiaJournal of Clinical Microbiology, 2005
- Evaluation of the Association of NineHelicobacter pyloriVirulence Factors with Strains Involved in Low-Grade Gastric Mucosa-Associated Lymphoid Tissue LymphomaInfection and Immunity, 2004
- Polymorphisms of Helicobacter pylori HP0638 Reflect Geographic Origin and Correlate with cagA StatusJournal of Clinical Microbiology, 2002