Yeni Nesil Dizileme Verilerinin Analizinde Bulut Teknolojisi
- 13 June 2022
- journal article
- Published by Nevsehir Bilim ve Teknoloji Dergisi in Nevşehir Bilim ve Teknoloji Dergisi
- Vol. 11 (1), 1-10
- https://doi.org/10.17100/nevbiltek.1005534
Abstract
Yeni nesil dizileme (YND) araçları, büyük miktarda veri üretme kapasitesine sahiptir ancak dizileme sonrası büyük ölçekli veri analizi için yeterli olmayan hesaplama ve depolama kapasitesi ile donatılmışlardır. Bulut bilişim altyapılarını kullanmak YND verilerinin analizi, depolanması ve aktarılması ile ilgili sorunlara alternatif bir seçenek olmuştur. Bulut bilişim, kullanıcılara dizileme verilerinin analizi için gerekli hesaplama kapasitesi ve bilişim altyapılarına erişim sunmakta ve biyoinformatik altyapıları için gerekli olan ön sermaye harcamalarının çoğunu ortadan kaldırmaktadır. Yapılan bu çalışmada yeni nesil dizileme yöntemi ve dizileme verilerinin analizinde kullanılan bulut bilişim platformaları hakkında bilgi verilmiştir.Keywords
This publication has 48 references indexed in Scilit:
- What is next generation sequencing?Archives of Disease in Childhood: Education & Practice, 2013
- Rainbow: a tool for large-scale whole-genome sequencing data analysis using cloud computingBMC Genomics, 2013
- Cloudgene: A graphical execution platform for MapReduce programs on private and public cloudsBMC Bioinformatics, 2012
- RAPSearch2: a fast and memory-efficient protein similarity search tool for next-generation sequencing dataBioinformatics, 2011
- SEAL: a distributed short read mapping and duplicate removal toolBioinformatics, 2011
- Galaxy CloudMan: delivering cloud compute clustersBMC Bioinformatics, 2010
- The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing dataGenome Research, 2010
- Ergatis: a web interface and scalable software system for bioinformatics workflowsBioinformatics, 2010
- CloudBurst: highly sensitive read mapping with MapReduceBioinformatics, 2009
- DIYA: a bacterial annotation pipeline for any genomics labBioinformatics, 2009