Introducción. Un recuento de plaquetas menor a 150,000 y normalidad en el resto del hemograma, son necesarios para considerar trombocitopenia inmune primaria (PTI). Aunque la patogénesis no ha sido enteramente dilucidada, se ha descrito una combinación de eventos caracterizados por aumento en la destrucción de las plaquetas mediados por la producción de autoanticuerpos. Publicaciones previas han reportado la presencia de autoanticuerpos en pacientes con PTI, anticuerpos anticardiolipina (75%), de anticuerpos antinucleares (ANAS) (33,3%) y anticuerpos antifosfolípido (AAF) (28,5%). Estudios en nuestro país describen características demográficas y sociales de los pacientes con PTI así como la respuesta al tratamiento, pero no existen descripciones de la presencia de autoanticuerpos. Objetivos. Identificar la prevalencia de autoanticuerpos en PTI, en el hospital universitario clínica San Rafael de Bogotá, en el periodo 2008 – 2012. Métodos. Se realizó un estudio observacional descriptivo, la población fue representada por adultos de ambos sexos mayores de 16 años con diagnóstico de trombocitopenia inmune primaria (PTI), en el hospital universitario clínica San Rafael de Bogotá, entre los años 2008-2012. Se excluyeron los pacientes con diagnostico confirmado de otra condición clínica como causa secundaria de trombocitopenia. Un total de 723 historias clínicas fueron revisadas, de las cuales 72 cumplieron los criterios de inclusión. Resultados. De 72 historias clínicas analizadas, el 69,6 % correspondieron a mujeres, los autoanticuerpos positivos fueron los ANAS con 59,7% seguido por los anticuerpos anticardiolipina (ACA) IgM con 18% y ACA IgG con 16.6%, para el caso del anticoagulante lúpico se halló positivo en el 9,7%. Los ANAS, positivos correspondieron a títulos > a 1:160 y a su vez el patrón moteado fue el más frecuente para el 41,8%, de los pacientes con recuento de plaquetas menores a 50,000 el 45% tenían anticoagulante lúpico positivo. En el 30,5% del total de casos se presentó alguna complicación, 59% fue sangrado. Conclusiones. En este estudio hallamos que los anticuerpos más frecuentes fueron los ANAS y Anticuerpos Anticardiolipina.