Capsicum chinense Türüne Ait Biber Popülasyonunun SSR Molekülerleri ile Karakterizasyonu
- 15 September 2021
- journal article
- Published by Yuzuncu Yil Universitesi Tarim Bilimleri Dergisi in Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi
- Vol. 31 (3), 722-732
- https://doi.org/10.29133/yyutbd.928181
Abstract
Genetik kaynaklarının karakterizasyonu ve çeşitlilik düzeylerinin belirlenmesinde morfolojik tanımlayıcılar ve moleküler analiz yöntemlerinden yararlanılmaktadır. Capsicum chinense biber türü; meyve özellikleri yönünden yüksek düzeyde varyasyon göstermektedir. Bu çalışmada, Capsicum chinense türüne ait biber genetik kaynaklarının (83 genotip) SSR yöntemine göre moleküler karakterizasyonu ile tür içerisindeki mevcut popülasyondaki varyasyon düzeyi ve genetik çeşitlilik düzeylerinin saptanması amaçlanmıştır. Moleküler analizler sonucunda, incelenen 14 SSR primerinden toplam 115 bant elde edilmiştir. Yapılan değerlendirme sonucunda, bantların 66 tanesinin polimorfik (% 57.4) ve 49 tanesinin ise monomorfik (% 42.6) olduğu belirlenmiştir. Capsicum chinense türüne ait biber genotipleri, SSR markörleri ile yapılan moleküler analizler sonucunda Ağırlık atanmamış komşu birleştirme yöntemine göre üç farklı heterojen genetik gruba ayrılmıştır. Ayrıca, C. chinense türüne ait biber genotipleri arasında genetik uzaklık değerlerinin 0.15-0.75 arasında değiştiği bulunmuştur. Bu çalışma sonucunda karakterizasyonu yapılmış olan C. chinense türüne ait biber genotiplerinde halen seleksiyon ıslahı çalışmalarına devam edilmektedir.Keywords
This publication has 28 references indexed in Scilit:
- Application of genetics and genomics towards Capsicum translational researchPlant Biotechnology Reports, 2013
- The taxonomy of the genus Capsicum.Published by CABI Publishing ,2012
- Overcoming Two Post-fertilization Genetic Barriers in Interspecific Hybridization between Capsicum annuum and C. baccatum for Introgression of Anthracnose ResistanceBreeding Science, 2006
- Genetic Variability in Pepper (Capsicum annuum L.) Estimated by Morphological Data and Amplified Fragment Length Polymorphism MarkersBiodiversity and Conservation, 2005
- EST and microarray analyses of pathogen-responsive genes in hot pepper (Capsicum annuum L.) non-host resistance against soybean pustule pathogen (Xanthomonas axonopodis pv. glycines)Functional & Integrative Genomics, 2004
- Characterization and molecular genetic mapping of microsatellite loci in pepperTheoretical and Applied Genetics, 2003
- Evaluation of genetic distances between pepper inbred lines for cultivar protection purposes: comparison of AFLP, RAPD and phenotypic dataTheoretical and Applied Genetics, 2001
- Abundance, variability and chromosomal location of microsatellites in wheatMolecular Genetics and Genomics, 1995
- Nuclear RFLP between pepper cultivars (Capsicum annuum L.)Euphytica, 1993
- Analysis of Gene Diversity in Subdivided PopulationsProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1973