Аналіз параметрів флуоресценції хлорофілу є потужним інструментом вивчення впливу найрізноманітніших екологічних факторів на рослинні організми. Хімічні чинники та кліматичні умови, часто будучи інгібіторами і активаторами біоенергетичних процесів, що протікають в Тилакоїди рослинних клітин, здатні надавати виражений вплив на параметри кінетики і спектральні особливості флуоресценції, а також на її стаціонарний рівень. Дослідження кінетики флуоресценції можуть дати важливу інформацію, що стосується характеру активності фактора зовнішнього середовища по впливу на параметри фотосинтезу - застосовну в цілях екологічного моніторингу, а також з метою оцінки стійкості рослин.Диференціальні вимірювання параметрів флуоресценції хлорофілу набагато менше залежать від реадсорбції червоного світла, якщо враховується кінетика флуоресценції. Розрахунок здебільшого вегетаційних індексів базується на двох найбільш стабільних (що не залежать від інших чинників) ділянках кривої спектральної відбивної здатності рослин. На червону зону спектра припадає максимум поглинання сонячної радіації хлорофілом, а на ближню інфрачервону зону максимальне відображення енергії клітинною структурою листа. Індекси цієї групи відображають загальну кількість рослинності і використовуються для оцінки її стану при вирішенні шірокогокруга завдань. Вони узагальнюють і відображають вплив таких чинників, як вміст хлорофілу, площа поверхні листя, щільність і структура рослинності. Основною метою цих показників є картування рослинного покриву, виявлення територій, покритих і не покритих рослинністю, оцінка та моніторинг стану рослинного покриву. Використання значень коефіцієнтів відбиття в вузьких спектральних зонах дозволяє використовувати індекси для реєстрації навіть невеликих змін стану рослинності.