As áreas úmidas (AU) brasileiras são ambientes com grande contribuição para a biodiversidade na América do Sul. A planície costeira do sul do Brasil é um complexo de áreas úmidas pouco conhecido ecológica e biologicamente. O clima desta área é subtropical úmido e compreende uma planície com cerca de 37.000 Km2, dos quais, aproximadamente 40 % constituem ecossistemas aquáticos. O principal impacto percebido é de ocupação agrícola, com cultivo principalmente de arroz irrigado, particularmente importante sobre a biodiversidade aquática. Nesse trabalho, apresentamos um levantamento da biodiversidade de invertebrados aquáticos (fitofauna e zooplâncton) ao longo de um gradiente de 200 Km em 20 AU localizadas na planície costeira do Sul do Brasil. Estas AU estão distribuídas em regiões com atividades agrícolas, ao sul, e de preservação ambiental, ao norte, inseridas em uma estação ecológica, sítio RAMSAR. Os resultados mostraram diferenças das variáveis limnológicas entre as duas regiões, principalmente turbidez e condutividade elétrica. Foram identificados 169 táxons de invertebrados aquáticos, sendo 60,5 % de fitofauna e 39,5 % correspondendo a táxons de zooplâncton. As duas regiões não apresentaram diferença em relação a riqueza, abundância e diversidade para nenhuma das assembleias e para a comunidade total, porém mostraram diferenças na composição em ambas as assembleias. Ocorreram 30 táxons exclusivos na região de preservação e 48 táxons exclusivos na região de matriz agrícola. Nossos resultados mostraram que a comunidade de invertebrados aquáticos regional possui alta biodiversidade comparada com levantamentos em regiões com amplitude espacial menor. Mesmo que nossos dados não abranjam uma grande variação latitudinal, a conectividade proporcionada pelo relevo com baixas altitudes e a grande quantidade de ambientes aquáticos rasos proporciona o estabelecimento de uma comunidade rica e diversa. Assim nosso estudo busca contribuir para reforçar a importância da planície costeira sul do Brasil como local de alta relevância ecológica para manutenção da biodiversidade. INVERTEBRATES DIVERSITY IN WETLANDS AT SOUTHERN BRAZIL: The Brazilian wetlands (UA) are environments with great contribution to biodiversity in South America. The coastal plain of southern Brazil is a complex of wetlands that is not well known ecologically and biologically. The climate of this area is humid subtropical and comprises a plain of about 37,000 km2, of which approximately 40% constitute aquatic ecosystems. The main impact perceived is of agricultural occupation, with cultivation mainly of irrigated rice, which is particularly important on aquatic biodiversity. In this work, we present a survey of the biodiversity of aquatic invertebrates (phytofauna and zooplankton) along a 200 km gradient in 20 UA located in the coastal plain of southern Brazil. These UA are distributed in regions with agricultural activities, to the south, and environmental preservation, to the north, inserted in an ecological station, RAMSAR site. The results showed differences in limnological variables between the two regions, mainly turbidity and electrical conductivity. A total of 169 aquatic invertebrate taxa were identified, 60.5 % of which were phytofauna and 39.5 % corresponding to zooplankton taxa. The two regions did not differ in terms of richness, abundance and diversity for any of the assemblages and for the total community, but showed differences in composition in both assemblages. There were 30 exclusive taxa in the preservation region and 48 exclusive taxa in the agricultural matrix region. Our results showed that the regional aquatic invertebrate community has high biodiversity compared to surveys in regions with smaller spatial amplitude. Even though our data do not cover a large latitudinal variation, the connectivity provided by the relief with low altitudes and the large amount of shallow aquatic environments provides the establishment of a rich and diverse community. Thus, our study seeks to contribute to reinforce the importance of the southern coastal plain of Brazil as a place of high ecological relevance for maintaining biodiversity.