Bu çalışma ile Adana ili 1. ve 2. ürün mısır alanlarında 2015-2016 yılı hasat döneminde, koçan çürüklüğüne neden olan fungal etmenler ve bu fungal etmenler ile bulaşık mısır örneklerinde toksin bulaşma seviyelerinin tespit edilmesi amaçlanmıştır. Tarama çalışmalarında toplam 134 mısır tarlasından örnekleme yapılmış ve elde edilen mısır tanelerinden Aspergillus, Fusarium ve Penicillium cinsi funguslar izole edilmiştir. İzole edilen bu fungusların morfolojik özelliklerine göre yapılan tanımlama sonucunda Aspergillus flavus, A. terreus, A. niger, Fusarium verticillioides, F. graminearum, F. culmorum, Penicillium verrucosum ve P. carneum türleri belirlenmiştir. Mısır örneklerinde mikotoksin (aflatoksin, T-2, zearalenon, okratoksin) araması için, CD-ELISA (Competitive Direct Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) analizi uygulanmıştır. Mikotoksin analizi sonucunda, 48 mısır örneğinde 0.3–72.6 μg/kg aflatoksin, 83 mısır örneğinde 1.5–75.0 μg/kg T-2, 134 mısır örneğinde 3.4–551.9 μg/kg zearalenon, 15 mısır örneğinde ise 1.0–6.5 μg/kg seviyelerinde okratoksin içerikleri belirlenmiştir.