Diversity of ng-mast and mlst sequence types in Russian clinical isolates of Neisseria gonorrhoeae carrying the «mosaic» allele of the penA gene

Abstract
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ Молекулярное типирование современной российской популяции N. gonorrhoeae, направленное на обнаружение эпидемиологически опасных NG-MAST- и MLST-сиквенс-типов, несущих «мозаичную» аллель гена penA с определяемой этим сниженной чувствительностью к препаратам выбора для терапии гонококковой инфекции — цефалоспоринам III поколения. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ В исследование включены 326 клинических изолятов N. gonorrhoeae, выделенных на территории Российской Федерации в 2018—2020 гг. NG-MAST-типирование проводили на основе секвенирования вариабельных участков генов porB и tbpB. MLST-типирование осуществляли на основе анализа нуклеотидных последовательностей семи генов «домашнего хозяйства»: abcZ, adk, aroE, fumC, gdh, pdhC и pgm. Структуру гена penA анализировали секвенированием по Сенгеру. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ Молекулярное типирование по протоколам NG-MAST и MLST относило изученные клинические изоляты N. gonorrhoeae к 110 и 41 различным сиквенс-типам соответственно. Секвенирование гена penA выявило «мозаичную» аллель XXXIV типа, кодирующую пенициллин-связывающий белок 2 со сниженной аффинностью к цефалоспоринам, у 7 (2,1%) исследованных клинических изолятов. Сопоставление результатов молекулярного типирования свидетельствовало об обнаружении данного аллеля у сиквенс-типов STNG-MAST2212/STMLST1901 (n=1); STNG-MAST3149/STMLST1901 (n=1); STNG-MAST5622/ /STMLST14011 (n=1) и STNG-MAST10025/STMLST1902 (n=4). Филогенетический анализ ассоциировал все названные сиквенс-типы с геногруппой STNG-MAST1407/STMLST1901, представляющей существенную опасность для глобальной системы здравоохранения. ЗАКЛЮЧЕНИЕ Результаты проведенного исследования демонстрируют дивергенцию сиквенс-типов, несущих «мозаичную» аллель гена penA, объясняя возникновение подобного разнообразия серией одиночных мутационных событий в генах porB, adk и fumC, учитываемых протоколами NG-MAST- и MLST-типирования.