Diversity of ng-mast and mlst sequence types in Russian clinical isolates of Neisseria gonorrhoeae carrying the «mosaic» allele of the penA gene
- 1 January 2022
- journal article
- Published by Media Sphere Publishing Group in Molecular Genetics Microbiology and Virology (Russian version)
- Vol. 40 (4)
- https://doi.org/10.17116/molgen20224004114
Abstract
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ Молекулярное типирование современной российской популяции N. gonorrhoeae, направленное на обнаружение эпидемиологически опасных NG-MAST- и MLST-сиквенс-типов, несущих «мозаичную» аллель гена penA с определяемой этим сниженной чувствительностью к препаратам выбора для терапии гонококковой инфекции — цефалоспоринам III поколения. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ В исследование включены 326 клинических изолятов N. gonorrhoeae, выделенных на территории Российской Федерации в 2018—2020 гг. NG-MAST-типирование проводили на основе секвенирования вариабельных участков генов porB и tbpB. MLST-типирование осуществляли на основе анализа нуклеотидных последовательностей семи генов «домашнего хозяйства»: abcZ, adk, aroE, fumC, gdh, pdhC и pgm. Структуру гена penA анализировали секвенированием по Сенгеру. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ Молекулярное типирование по протоколам NG-MAST и MLST относило изученные клинические изоляты N. gonorrhoeae к 110 и 41 различным сиквенс-типам соответственно. Секвенирование гена penA выявило «мозаичную» аллель XXXIV типа, кодирующую пенициллин-связывающий белок 2 со сниженной аффинностью к цефалоспоринам, у 7 (2,1%) исследованных клинических изолятов. Сопоставление результатов молекулярного типирования свидетельствовало об обнаружении данного аллеля у сиквенс-типов STNG-MAST2212/STMLST1901 (n=1); STNG-MAST3149/STMLST1901 (n=1); STNG-MAST5622/ /STMLST14011 (n=1) и STNG-MAST10025/STMLST1902 (n=4). Филогенетический анализ ассоциировал все названные сиквенс-типы с геногруппой STNG-MAST1407/STMLST1901, представляющей существенную опасность для глобальной системы здравоохранения. ЗАКЛЮЧЕНИЕ Результаты проведенного исследования демонстрируют дивергенцию сиквенс-типов, несущих «мозаичную» аллель гена penA, объясняя возникновение подобного разнообразия серией одиночных мутационных событий в генах porB, adk и fumC, учитываемых протоколами NG-MAST- и MLST-типирования.This publication has 21 references indexed in Scilit:
- WGS to predict antibiotic MICs for Neisseria gonorrhoeaeJournal of Antimicrobial Chemotherapy, 2017
- Molecular epidemiology of drug-resistant Neisseria gonorrhoeae in Russia (Current Status, 2015)BMC Infectious Diseases, 2016
- Antimicrobial susceptibility/resistance and NG-MAST characterisation of Neisseria gonorrhoeae in Belarus, Eastern Europe, 2010–2013BMC Infectious Diseases, 2015
- Antimicrobial Resistance in Neisseria gonorrhoeae in the 21st Century: Past, Evolution, and FutureClinical Microbiology Reviews, 2014
- Molecular Characterization and in Silico Analysis of a Novel Mutation in TEM-1 Beta-Lactamase Gene among Pathogenic E. coli infecting a Sudanese PatientAmerican Journal of Microbiological Research, 2014
- Emergence and Characterization of Neisseria gonorrhoeae Isolates With Decreased Susceptibilities to Ceftriaxone and Cefixime in CanadaSexually Transmitted Diseases, 2012
- Molecular Surveillance of Clinical Neisseria gonorrhoeae Isolates in RussiaJournal of Clinical Microbiology, 2010
- Species status of Neisseria gonorrhoeae: evolutionary and epidemiological inferences from multilocus sequence typingBMC Biology, 2007
- Rapid Sequence‐Based Identification of Gonococcal Transmission Clusters in a Large Metropolitan AreaThe Journal of Infectious Diseases, 2004
- Multi-Locus Sequence TypingPublished by Springer Science and Business Media LLC ,2001